Im Zentrum der Handlung steht der aufopferungsvolle Kampf des Studenten Jan Palach gegen die sowjetische Besetzung der Tschechoslowakei, der im Januar 1969 in seiner Selbstverbrennung gipfelt. Die junge Anwältin Dagmar Burešová vertritt später Palachs Familie im Kampf gegen die kommunistischen Politiker, die seinen Namen und sein Opfer für die Freiheit verleumdet haben.

Prag gegen Ende des 14. Jahrhunderts: König Wenzel, sein Bruder Sigismund, der Prager Erzbischof Zbynek und drei Päpste stehen sich in einem Machtkampf gegenüber. Alle erheben Anspruch auf Einflussnahme über den Heiligen Stuhl. Jan Hus, Magister der Karls-Universität und Prediger, fühlt sich mitverantwortlich für das Schicksal der gespaltenen Kirche und ihrer Gläubigen, für die sie Vorbildfunktion hat. So zieht er den Groll der Mächtigen auf sich. "Jan Hus" ist die Geschichte eines Mannes, der aufgrund seiner Überzeugung im Kampf der Meinungen und Ambitionen von kirchlichen und weltlichen Autoritäten dem Tod ins Antlitz schaute.