Nachdem das gelbe Krakenwesen aus dem All den Widerstand der Erdmenschen gebrochen hat, gibt er ihnen gnädigerweise eine letzte Chance. Ein Jahr lang wird er die Klasse 3-E der Kunugigaoka-Schule unterrichten, ein Sammelbecken für die widerspenstigsten, undizipliniertesten, lernschwächsten Teens der ganzen Gegend. Und wenn diese es auch noch schaffen sollten, ihn im Laufe des Jahres umzubringen, dann wäre die Welt gerettet. Koro-sensai, so heißt der Außerirdische, hat jedoch übermenschliche Kräfte, mit denen er jedes Attentat abwehren kann. Aber darüber hinaus zeigt er sich auch noch als exzellenter Lehrer. Sollten die Schüler ihn umbringen, dann verschwindet auch der Einzige, der sich jemals um sie bemüht hatte. Eine unlösbare Aufgabe … vielleicht … denn die Abenteuer von Koro-sensai und der Klasse 3-E werden fortgesetzt.

Auch im zweiten Teil der Live Action Verfilmung der erfolgreichen Mangas versuchen die Schüler der Klasse 3-E der der Kunugigaoka-Schule alles, um ihren außerirdischen Lehrer zu töten. Das Schuljahr nähert sich seinem Ende, und die Zeit für Attentat wird knapp. Da erhält Koro-sensai unerwarteten Besuch aus seiner Vergangenheit, eine Begegnung, die das Leben seiner Schüler auf den Kopf stellt.

Naoto Mitsui (Kengo Kôra) war schon als Kind ein Außenseiter, der von allen einfach ignoriert wurde. Daran ändert sich auch nichts, als er erwachsen ist. Während seiner Schulzeit war Chihiro (Kanako Nishikawa) die einzige Person, die Naoto zumindest ein wenig Beachtung schenkte. Weshalb er schon lange davon träumt, sie wiederzusehen. Nach elf Jahren Suche gelingt es ihm endlich, sie ausfindig zu machen. Aber Chihiro hat sich vollkommen verändert. Dennoch ist Naoto wie besessen von ihr. Er verfolgt sie, beobachtet sie und mutiert zu einem regelrechten Stalker. Irgendwann schleicht er sich sogar in ihr Heim und versteckt sich unter dem Bett. Dort muss er Zeuge von der gewalttätigen Beziehung werden, die seine Angebetete und ihr tyrannischer Ehemann (Ken’ichi Abe) führen …